تنقية البروتين protein purification هي سلسلة العمليات الرامية إلى عزل بروتين ٍ واحدٍ من خليط حيوي معقد من أجل تحديد خصائصه ووظيفته وتفاعلاته وبنيته لأغراض إما تحضيرية تنتج كميات كبيرة نسبياً من البروتين لاستخدامات لاحقة، كإنتاج مستحضرات تجارية من إنزيم ما (مثل اللاكتاز)، أو بروتين مغذٍ (مثل بروتين فول الصويا)، أو مستحضرات صيدلانية حيوية (مثل الإنسولين)؛ وإما تحليلية مختلفة كيفية أو كمية، كما هي الحال في تنقية بروتيني الببسين واليورياز.
